合格性考试与选考的区别主要体现在五个方面：两者的考试目的不同，合格性考试旨在检验学生是否达到普通高中课程方案规定的基本学业要求，强调“达标”；而选考则在学生达标的基础上，具有选拔和区分功能，突出学生的学科特长。考试科目也有差异，合格性考试涵盖国家课程方案规定的14个科目，而选考则允许学生在特定科目中自主选择。第三，考试范围不同，合格性考试涉及各学科课程标准确定的必修内容，选考则包括必修和选择性必修内容。第四，成绩呈现方式各异，合格性考试以“合格/不合格”和等级形式呈现，选考则首选科目以原始分呈现，再选科目以等级转换分形式呈现。最后，成绩的使用目的不同，合格性考试成绩是高中毕业和同等学力认定的关键，也是参加选考的前提；选考成绩则计入总成绩，成为普通高校招生录取的重要依据。

合格性考试的重要性体现在以下三个方面：一是它是获得高中毕业资格的必要条件；二是它是参加相应选考科目等级性考试的先决条件；三是对于申请部分重点大学的特殊类型招生，如上海的综合评价和浙江的三位一体，合格性考试成绩在初审阶段也会被参考。