平行志愿的录取遵循“分数优先，志愿优先”的原则，首先对同批次考生进行总分排序，然后按照志愿填报顺序进行一次性投档。具体操作是，系统会先检查考生填报的第一志愿院校是否有剩余名额，如有则投档成功；若第一志愿已满，则依次检查第二、第三志愿，直至找到有空余名额的志愿院校。若所有志愿均已满，则该考生在本批次投档中未被录取。

与顺序志愿相比，平行志愿的显著区别在于投档原则。顺序志愿以考生志愿为首要考量，优先满足考生志愿需求，对同一志愿的考生按调档比例从高分到低分投档。例如，若考生将某高校设定为第二志愿，即使其分数较高，若该高校一志愿已满且不招收第二志愿考生，则其档案不会被投至该校。而平行志愿则强调“分数优先”，即考生先按总分排序，再根据志愿顺序进行投档，直至找到符合分数要求的志愿院校。一旦投档成功，不再考虑该考生其他志愿。