深圳大学在众多学科领域中脱颖而出，其中计算机、建筑学、土木工程、光学工程、生物医学工程以及信息与通信工程等专业尤为突出，成为该校的王牌专业。该校在工学领域表现尤为出色，计算机、建筑学、土木工程、光学工程、生物医学工程、信息与通信工程等专业均具备较高水平。同时，在人文社科领域，新闻传媒、经济学、法学等学科也颇具实力。

国家级特色专业建设点集中在电子信息工程、建筑学、工商管理、计算机科学与技术、金融学等领域。省级特色专业建设点则包括电子信息工程、建筑学、工商管理、计算机科学与技术、金融学，以及生物技术、法学、广告学、光信息科学与技术、自动化等。此外，光学工程、政治经济学、国际法学、文艺学、传播学、光学、细胞生物学、材料物理与化学、通信与信息系统、信号与信息处理、建筑设计及其理论、结构工程等均为省级重点学科。