当公司在被起诉后注销，处理方式通常如下：

**以股东、发起人或出资人为被告** ：

- 如果公司在注销前已经依法成立了清算组，并依照公司法进行了清算，则诉讼可能会中止或终止，债权人可以根据公司清算程序来实现自己的权利。

- 如果公司在未经清算的情况下被注销，债权人可以向法院起诉公司的股东，要求股东对公司的债务承担连带责任。

**法律依据** ：

- 根据《中华人民共和国公司法》第一百八十八条，公司清算结束后，清算组应制作清算报告，报股东会、股东大会或人民法院确认，并申请注销公司登记。

- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第六十四条规定，企业法人解散的，在依法清算并注销前，以该企业法人为当事人；未依法清算即被注销的，以该企业法人的股东、发起人或者出资人为当事人。

**注销程序** ：

- 公司注销需要按照一定的流程进行，包括拿到国税和地税的注销税务登记通知书，办理银行账户销户，并在工商局办理公司注销备案和公告。

**特殊情况** ：

- 如果被注销登记的企业存在权利义务承受人，根据具体情况，法院可能会直接变更权利义务承受人为诉讼主体；如果没有权利义务承受人或权利义务承受人表示不参加诉讼，则诉讼可能会被终结。

请根据具体情况采取相应的法律行动。如果有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时告知