国防生与军校生在选拔流程、校园待遇及毕业后的福利方面存在显著差异。

选拔方式各异。军校生通常是通过国家统一招生考试或保送方式进入军队院校，毕业后由军队统一分配。而国防生则是在地方普通高校中，从高考生或在校大学生中选拔，作为后备军官培养。

在校待遇存在差异。国防生在校期间可享受每年15000元（研究生18000元）的国防奖学金，并有机会获得其他非义务性奖学金。相比之下，军校生享受的是军队学员供给制待遇，包括免费军装、军衔、伙食、医疗以及承担全部学费，并从入学之日起计算军龄。

毕业后待遇不同。国防生毕业后，在服从部队需要的前提下，可在多个部门选择工作岗位，并正式入伍，被任命为中尉，享受同地区同职级军官待遇。军校生则按照“计划分配、挥需补充、面向基层、专业对口、合理使用”的原则分配，通常从事与所学专业相关的工作，分配到基层部队的将被任命为现役军官，而分配到院校、科研等单位的则多被任命为文职干部。

关于哪一种更好，军校生通常被认为更具优势，因为其直接入校即有军籍，毕业后军衔较高，且在校期间有津贴补助。国防生虽然自由度较高，但并非军事化管理，且部分费用需自行承担。

两者均具有较高的录取难度。军校生需高考分数线超过一本30分以上，且体检、政审无瑕疵，特别是视力要求严格。国防生虽然视力要求略放宽，但名额相对较少，录取难度与军校生相当。需要注意的是，国防生在校期间无军籍，而军校生入校即获得军籍，此外，军校全供给制，而国防生仅学费全供给。