中国海洋大学学科设置丰富，涵盖了地球科学、植物学与动物学、工程技术、化学、材料科学、农学、生物学与生物化学、环境学与生态学、药理学与毒理学等多个领域。具体专业设置如下：

海洋与大气学院：海洋科学、海洋科学类（中外合作办学）、军事海洋学、大气科学、应用气象学。

信息科学与工程学院：物理学、海洋技术、光电信息科学与工程、电子信息科学与技术、电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术、保密管理。

化学化工学院：化学、化学工程与工艺。

海洋地球科学学院：地质学、勘查技术与工程、地球信息科学与技术。

海洋生命学院：生物科学、生物技术、生态学。

水产学院：水产养殖学、海洋资源与环境、海洋渔业科学与技术。

食品科学与工程学院：食品科学与工程、生物工程、海洋资源开发技术。

医药学院：药学。

工程学院：土木工程、工程管理、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程、机械设计制造及其自动化、工业设计、自动化、轮机工程、航海技术。

环境科学与工程学院：环境科学、环境工程。

管理学院：工商管理、会计学、财务管理、市场营销、电子商务、旅游管理。

经济学院：金融学、国际经济与贸易、物流管理、经济学（海洋经济方向）。

外国语学院：英语文学、日语文学、朝鲜语文学、法语文学、德语文学。

文学与新闻传播学院：汉语言文学、文化产业管理、新闻学、编辑出版学、网络与新媒体。

法政学院：法学、法学类（中外合作办学）、社会学、政治学与行政学、公共事业管理、行政管理。

数学科学学院：数学与应用数学、信息与计算科学。

材料科学与工程学院：材料科学与工程、材料化学、高分子材料与工程。

教育系：教育技术学。

体育系：运动训练。

艺术系：音乐表演。